Βαλκανικοί Πόλεμοι
Η συγκεκριμένη συλλογή, επικεντρώνεται στο να διατηρήσει ζωντανά στην μνήμη, τα κατορθώματα του Ελληνικού Στόλου κατά τη διάρκεια των Βαλκανικών Πολέμων. Έτσι, κανείς μπορεί να παρατηρήσει προσωπικά αντικείμενα του Ναυάρχου Παύλου Κουντουριώτη, τα οποία προσφέρθηκαν στο Ναυτικό Μουσείο από την σύζυγο του εγγονού του (Μάντυ Κουντουριώτη), δελτία Πανελλήνιου Εράνου για την ενίσχυση του Ελληνικού Στόλου αλλά και φωτογραφικά ντοκουμέντα, τα οποία δόθηκαν ως δωρεά από το Ναυτικό Μουσείο της Ελλάδας και από ιδιώτες . Σε αυτές τις φωτογραφίες απαθανατίζονται πρόσωπα του Πολεμικού Ναυτικού αλλά και σκηνές από την Ιστορία της Ελλάδος. Ακόμη, εκτίθενται τρεις σημαίες εξέχουσας σημασίας: Ελληνική Σημαία Θαλάσσης της περιόδου των Βαλκανικών Πολέμων, με τα αρχικά Ζ.Ε.Κ(Ζήτω Ελεύθερη Κρήτη), Ελληνική σημαία όμοια με εκείνη που υψώθηκε την 1η Δεκέμβρη του 1913 στο Φρούριο του Φιρκά στα Χανιά(Δωρεά Ι.Ε.Ε.) καθώς και η σημαία που υψώθηκε στο Φιρκά την 1η Δεκέμβρη του 2013, ανήμερα της επετείου των 100 χρόνων Ένωσης με την Κρήτη. Δεν θα μπορούσαν να λείπουν από την συλλογή μοντέλα σημαντικών πολεμικών πλοίων εκείνης της Ιστορικής περιόδου: Το Θωρηκτό «Αβέρωφ», το οποίο έλαβε μέρος στις νικηφόρες Ναυμαχίες της «Έλλης» και της «Λήμνου», το αντιτορπιλικό «Νίκη», το υποβρύχιο «Δελφίν», το πρώτο υποβρύχιο που επιτέθηκε με τορπίλες σε τούρκικο καταδρομικό (1912), το Θωρηκτό «Κιλκίς», το θωρηκτό «Σπέτσες-Ύδρα-Ψαρά» και η Κανονιοφόρος «Σφακτηρία». Τέλος, χαρακτηριστικά είναι το σπαθί Αξιωματικού Πολεμικού Ναυτικού(δωρεά από τον Αρχηγό του Πολεμικού Ναυτικού) και τα όπλα της Εποχής των Βαλκανικών πολέμων.
