Έγγραφα της συλλογής Rene Puaux, εκ των οποίων η πλειοψηφία επιστολές σημαινόντων προσώπων της Γαλλίας, κ.ά. περί της αγωνιζόμενης Ελλάδας, μουσικά τεμάχια, κ.ά. A': έξι (6) έγγραφα α-στ' (χωρίς αρίθμηση των ετών 1807-1809, 1813) & τα υπ' αριθμ. 1-67 έγγραφα (1802, 1825-1829, 1831-1832, 1835-1838, 1840, 1845-1847, 1850). Β': τα υπ' αριθμ. 68-94 έγγραφα [18 επιστολές του αρχείου του Γαλλικού Φιλελληνικού Κομιτάτου, επιστολές, βιογραφικά σημειώματα, μία (1) παρτιτούρα και μια (1) μετάφραση δημοσιευμένης επιστολής].

Το βιβλίο "Dossiers secrets de la Triple Entente, Grece, 1914-22", Paris 1922, με προσθήκες και επιπλέον 23 φωτογραφίες

Επιστολές προς Ernst Ziller (1878-1890) σχετικά με την ανέγερση του μεγάρου της Ακαδημίας Αθηνών. Τοπογραφικό σχέδιο μεγάρου Ακαδημίας Αθηνών, 1859

Τον Φεβρουάριο του 2009 εκτέθηκαν για πρώτη φορά αντικείμενα από πολύτιμες ύλες, χρυσά και αργυρά κοσμήματα, αργυρά σκεύη, σφραγιδόλιθοι και ελεφαντοστέινα έργα μικρογλυπτικής, που φυλάσσονταν στο Εθνικό Αρχαιολογικό Μουσείο. Η Συλλογή είναι μία από της σημαντικότερες στον κόσμο χάρη στην ποιότητα και τη μοναδικότητα των αντικειμένων αλλά και επειδή είναι γνωστή η προέλευση πολλών από αυτά.

Συλλογή Γεώργιου Γεωργόπουλου: συγχαρητήριες επιστολές από σημαίνοντα πρόσωπα της Εκκλησίας και της Πολιτείας για το συγγραφικό του έργο.

Προκήρυξις Νομάρχου Αχαϊας και Ήλιδος Α. Ιερομνήμονος, 1886

Εκδόσεις του 19ου και 20ου αιώνα από την περιοχή της Σμύρνης

Η συλλογή περιλαμβάνει ένα φάκελο με στοιχεία για τον Γρηγόρη Γιάνναρο, τον Μπάμπη Δρακόπουλο, το ΚΚΕ Εσ. κλπ.

Η Αιγυπτιακή Συλλογή του Εθνικού Αρχαιολογικού Μουσείου κατέχει σημαντική θέση παγκοσμίως λόγω του πλούτου, της ποιότητας και της σπανιότητας των αντικειμένων της. Τον πυρήνα της Συλλογής αποτελούν οι μεγάλες δωρεές δύο φιλότεχνων ομογενών από την Αίγυπτο, του Ιωάννη Δημητρίου και του Αλέξανδρου Ρόστοβιτς, που δωρίθηκαν στο Εθνικό Αρχαιολογικό Μουσείο το 1880 και το 1904 αντίστοιχα. Η Συλλογή εμπλουτίστηκε από τις δωρεές της Ελληνικής Αρχαιολογικής Εταιρείας το 1894, της Αιγυπτιακής κυβέρνησης το 1893, άλλες μεμονωμένες μικρότερες δωρεές, καθώς και αντικείμενα προερχόμενα από ανασκαφές στον Ελλαδικό χώρο.

Συλλογή Αικατερίνης Μάνου: αλληλογραφία, φωτογραφίες, καρτ-ποστάλ.

Η συλλογή Αλέκου Σόφη περιλαμβάνει ανακοινώσεις φοιτητικών οργανώσεων Ηπειρωτών, δημοκρατικών και ακροδεξιών “εθνικοφρόνων” (1965–1966). Διώξεις δημοκρατικών φοιτητών και πολιτών στα Γιάννινα την εποχή της δικτατορίας (1967–1974) και απόφαση Συμβουλίου Πλημμελειοδικών Ιωαννίνων (1976) για βασανιστές κ.ά. (φωτοαντίγραφα).

1. Συλλογή επιστολών δημοτικιστών που συγκροτήθηκε από τον καθηγητή Σταμάτη Καρατζά και εκδόθηκε στον τόμο: Από την αλληλογραφία των πρώτων δημοτικιστών. 562 γράμματα των Ε. Γιαννίδη, Ι. Δραγούμη, Α. Εφταλιώτη, Κ. Παλαμά, Δ. Ταγκόπουλου, Γ. Ψυχάρη κ.ά., Συλλογή υλικού Σταμάτης Καρατζάς, επιμέλεια έκδοσης Ε.Δ.Π. του Σπουδαστηρίου Νεότερης Ελληνικής Φιλολογίας του Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, Α.Π.Θ., Επιστημονική επετηρίδα της Φιλοσοφικής Σχολής Παράρτημα 60, 1985. Σε πολλές περιπτώσεις πρόκειται για αντίγραφα επιστολών από τον Σ. Καρατζά. 2. Επιστολές του Φ. Φωτιάδη προς τον Α. Πάλλη (1904-1930) και προς τον Π. Βλαστό (1907-1909) και ανακοίνωση του Φωτιάδη προς τα μέλη του «Αδερφάτου της Εθνικής Γλώσσας» (1908). Δημοσιεύθηκαν στο Γ. Παπακώστας, Ο Φώτης Φωτιάδης και το αδερφάτο της εθνικής γλώσσας, Αθήνα, Ε.Λ.Ι.Α., 1985.

Συλλογή Αλτηγού: προσωπικά έγγραφα, σημειωματάρια, τεχνικά περιοδικά, αρχείο των έργων του Στρυμόνος, δακτυλόγραφα δύο μελετών υδρολογίας.

Συλλογή εγγράφων Αναγνώστη Πετμεζά.