Συλλογή Χώτζη: 1. Επτά (7) επιστολές και έγγραφα από το αρχείο Δασίου, 2. Δέκα (10) επιστολές κατά το πλείστον των χρόνων πριν την Επανάσταση, 3. Έντεκα (11) έγγραφα της εποχής του Αλή πασά, λογαριασμοί και διαταγές (1810-1815), 4. Λογαριασμός (1805), 5. Λογαριασμός (1807), 6. Επτά (7) επιστολές και ένας (1) λογαριασμός αναφερόμενος σε Φαναριώτικες οικογένειες, 7. Σημείωμα (1808), 8. Ιδιωτικό κατάστιχο, που περιέχει σημειώματα και λογαριασμό (1800-1809), 9. Σημείωμα (1812), 10. Παλιό αντίγραφο διατάξεων της Φιλόμουσου Εταιρείας 11-12. Κατάλογοι, 13. Φορολογικός πίνακας που εμφανίζει το αντίτιμο των δημόσιων κτημάτων του σαντζακίου Ναυπάκτου, 14. Διαταγή με οπισθόγραφο των μαστόρων "'όπου δουλεύουν στο κάστρο Παντοκράτορα" (Πρέβεζα, 1818), 15. Τεύχος (1829).

Συλλογή Χώτζη: 1. Εξήντα επτά (67) ιδιωτικά έγγραφα, από τα οποία τα περισσότερα εμπορικά (1715-1855), 2. Φάκελος περιέχων: -Δύο (2) ομολογίες πίστεως λατινιστί, -Δήλωση πίστεως προς τον Αλή πασά -Κρυπτογραφικό έγγραφο, -Απόσπασμα χειρογράφου, -Τέσσερα (4) βλαχικά γράμματα, -Πέντε (5) τουρκικά γράμματα με ελληνικούς χαρακτήρες, - Επιστολή προς τον τσάρο των Τατάρων λατινιστί, 3. Τριάντα δύο (32) ιδιωτικά έγγραφα, από τα οποία τα περισσότερα προς το Χρ. Ζωγράφο (1766;-1869), 4. Εικοσιεπτά (27) επιστολές, εκ των οποίων οι περισσότερες μητροπολιτών προς τον εθνικό ευεργέτη Χρ. Ζωγράφο (1865-1869).

Συλλογή Χώτζη: 1. Τουρκικό έγγραφο περί του εν Ναυπλίω προερχόμενων νέων ειδήσεων (1825), 2. Επιστολή περιέχουσα πολιτικές ειδήσεις από Κωνσταντινούπολη (1789), 3. Τρία (3) ενετικά έγγραφα του τέλους του ιζ αι. 4. Πενήντα εννιά (59) τουρκικοί φετφάδες (fetwas), 5. Έγγραφο που περιέχει έκθεση υπαλλήλου τινός του Σουλτάνου, 6. Επτά (7) αυτοκρατορικά φιρμάνια και βεράτια, 7. Δεκαπέντε (15) εκθέσεις βεζιρών (τακρίρια) προς τους σουλτάνους.

Η Συλλογή Σημαντική δωρήθηκε στο Ελληνικό Δημόσιο το 1935 και περιλαμβάνει κυρίως αγγεία, κοροπλαστική, νομίσματα, κ.α.

Συλλογή Σουβατζόγλου: περιέχει υλικό σχετικό με επιχειρήσεις εριουργίας.

Συλλογή σπάνιων βιβλίων που ανήκουν στην Βιβλιοθήκη του Πανεπιστημίου.

Ψηφιοποιημένα σπάνια βιβλία που ανήκουν στην Βιβλιοθήκη του Πανεπιστημίου.

Μικρά συλλογή εγγράφων αναφερομένων στη δράση των αδελφών Σπυρίδωνα και Νικόλαου Σπηλιωτόπουλου.

Συλλογή υπό τον τίτλο "Δωρεά Σπυρίδωνος και Ροζίνας Σίμου", περιέχουσα επιστολές, δελτάρια, επισκεπτήρια του Πρωθυπουργού Ελευθέριου Κ. Βενιζέλου και άλλων προς τον εκδότη της εφημερίδος "ΠΑΤΡΙΣ" Σπυρίδωνα Σίμο και αυτόγραφο ημερολόγιο του Σπ. Σίμου.

Η Συλλογή Σταθάτου καλύπτει ένα χρονικό φάσμα από την 6η χιλιετία π.Χ. μέχρι και τους μεταβυζαντινούς χρόνους. Τα αντικείμενα μεμονωμένα ή ενοποιημένα κατά σύνολα παρουσιάζονται κατά τη χρονολογική τους εξέλιξη.

Τα έργα "Οι αγώνες της Ξάνθης εναντίον του βουλγαρικού επεκτατισμού 1892-1919" (1964) και "Απαντήσεις εις υποβληθέντα ερωτήματα υπό του Ι.Α.Ν.Ε." (1964).

Συλλογή Σταυρούλας Νοταρά: δικαιοπρακτικά, νοταριακά έγγραφα, κατάλογοι διαφόρων ειδών, επιστολές, άδεια επιτηδεύματος Ιωάννη Κρανιδιώτη, κ.ά.

Η συλλογή περιλαμβάνει έγγραφα και σημειώματα σχετικά με την τοπική ιστορία της Κρήτης.

"Συλλογή Στέφανου Ξένου περιέχουσα: 1. Σχέδιο επιστολής Στ. Ξένου και Θρασύβουλου Ζαΐμη, 2. Επιστολή Ιωάννη Γενναδίου προς Στ. Ξένο, 3. Έγγραφο Εφόρου Βουλευτηρίου, 4. Συμφωνητικό μεταξύ Στ. Ξένου και Λουδοβίκου Roussin, 5. Τριάντα (30) επιστολές προς Στ. Ξένο, 6. Ανταπόκριση από Κωνσταντινούπολη για ""Βρετανικόν Αστέρα"", 7. Απόσπασμα μυθιστορήματος Στ. Ξένου, 8. Σχέδιο προεκλογικού λόγου Στ. Ξένου προς το λαό Σύρου και Μυκόνου, 9. Σατυρικό διήγημα Στ. Ξένου, 10. Προσκλήσεις προς Στ. Ξένου."

Η συλλογή περιέχει κυρίως έντυπο ενημερωτικό υλικό της ΕΔΑ, του ΚΚΕ Εσ., της ΕΑΡ και των οργανώσεων νεολαίας της Αριστεράς αφενός και αντίγραφα δικαστικού υλικού από δίκες βασανιστών της επταετίας που διεξήχθησαν στη Θεσσαλονίκη και δίκες φοιτητών και άλλων πολιτών κατά τη μεταπολίτευση αφετέρου. Τη συλλογή συμπληρώνει πλειάδα σχετικών εκδόσεων και περιοδικών. Αποτελείται από 19 φακέλους.